文史哲研究院哲学研究所的历史可以追溯到1978年成立的原文史哲研究所自然辩证法研究室，该研究室是中国高等院校中成立最早的科技哲学研究机构之一。2002年，山东大学文史哲研究院成立，原文史哲研究所从事科技哲学及其相关研究的研究人员组合建立科技哲学研究所，成为新组建的文史哲研究院直接管辖的研究机构。2008年，根据研究所发展的现状，科技哲学研究所更名为哲学研究所。现任所长马来平教授。

    本研究所的研究主要集中在科技哲学与外国哲学两个领域。在科技哲学领域，本研究所的鲜明特色主要体现在“科技与社会研究”方面。马来平教授科技文化和科学社会学等方面发表了一批较有影响的学术论著，在学界享有较高声誉，常春兰博士对科学合理性和相对主义的研究，在西方科学哲学领域亦正逐渐引起学界关注。在外国哲学领域，本研究所的鲜明特色主要体现在“批判理论”、“诠释学”、“德国古典哲学”和“现代犹太哲学”方面。傅永军教授围绕哈贝马斯哲学对批判理论现代性问题的研究、围绕康德哲学对德国观念论的研究、围绕利奥·拜克对现代犹太宗教哲学的研究以及对西方诠释学及其中国诠释学学科建设的探索，在学术界都产生了较大影响。

    本研究所与山东大学哲学与社会发展学院哲学系保持着密切的研究合作关系，以哲学系外国哲学教研室和科技哲学教研室为主体，共同建设外国哲学（1986年获硕士学位授予权，2003年获博士学位授予权）和科技哲学博硕士点（1998年获硕士学位授予权，2006年获博士学位授予权）以及哲学一级学科博士后流动站（2003年获准设立）。目前本研究所可以在科技哲学和外国哲学两个二级学科招收硕士研究生和博士研究生，亦可以外国哲学和科技哲学二个二级学科接受博士后研究人员进站从事研究工作。本研究所的外国哲学博士点设有近代欧洲哲学、批判理论与西方马克思主义、诠释学与现象学、西方政治哲学、中外比较哲学等研究方向；科技哲学博士点设有科技与社会、中国近现代科技社会史、科学文化等研究方向。